"固本消积方"调控肝癌铜死亡生物信息学及体外实验机制研究
侯宗玮1
李俊熙1
杨仁义1
刘竞择1
曾普华2
1.410208,湖南长沙,湖南中医药大学2.410205,湖南长沙,湖南省中西医结合医院肿瘤科;410205,湖南长沙,湖南省中医药研究院肿瘤研究所
摘要：目的 应用生物信息学技术筛选固本消积方干预肝癌铜死亡的作用靶点及相关信号通路,通过体外实验明确其作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库分析平台和Herb数据库收集筛选中药复方活性成分及靶点;结合基因表达综合数据库、癌症基因图谱数据库获取肝癌差异基因及铜死亡相关基因,利用R语言分析核心靶点;采用String、David数据库进行蛋白质相互作用网络及GO/KEGG富集分析;Lasso回归筛选关键基因.制备固本消积方含药血清,体外培养HepG2及Lo2细胞.分别使用20%空白血清、20%含药血清干预48 h后,采用实时荧光定量聚合酶链反应验证基因表达.结果 收集筛选出固本消积方有效成分219个,作用靶点794个;肝癌差异基因827个,铜死亡相关性基因44 123个,核心差异基因64个.蛋白质相互作用网络显示,MYC、EGF、EGFR、SREBF1、LDHA等56个关键靶点.GO、KEGG富集分析结果显示607个生物进程及20条通路.Lasso回归确定LDHA、AKR1B10等6个核心基因,其中LDHA、AKR1B10等5个基因低风险组预后良好(P<0.05).结论 固本消积方可能通过LDHA、AKR1B10等靶点调控铜死亡,诱导HepG2细胞死亡,具体机制需进一步验证.
关键词：固本消积方肝癌铜死亡生物信息学
分类号：R273(中医肿瘤科学)
资助基金：国家自然科学基金(82074425)湖南中医药大学研究生创新课题项目(2022CX195)
论文发表日期：2025-03-20
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 147-156 )
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