2017年锦州市输入性病例疟原虫18S rDNA基因种类鉴定及序列分析
张振1
王子江2
毛玲玲2
孙英伟2
王博2
蔡灵琰1
白梅1
张旭1
姚文清2
1.锦州市疾病预防控制中心,辽宁锦州,1210002.辽宁省疾病预防控制中心,辽宁沈阳,110000
摘要:目的 研究锦州市输入性病例疟原虫18S rDNA的基因差异和种系发育.方法 收集2017年2例输入性疟疾患者血样,提取血样中的疟原虫DNA,采用巢式PCR对其18S rDNA基因进行扩增、测序分析,并与GenBank中疟原虫相应序列进行比较分析,利用邻接法(neighbor joining,NJ)构建系统进化树.结果 2例患者PCR电泳结果获得片段均为205 bp,是恶性疟原虫感染.从系统进化树中显示,2个检测基因片段与恶性疟原虫形成一个分支,与GenBank中来自喀麦隆(KC428741、KC428742)、巴西(KC906718)和马来西亚(HQ283221)等7个分离株聚集在一起,具有很高的相似性(98.5%~99.0%),与来自印度(HM014353)的相似性较高(98.0%~98.5%),与其他间日疟原虫、三日虐原虫、卵型疟原虫、诺氏疟原虫基因序列相似性较低(36.4% ~64.2%).结论 2例输入性疟疾患者感染的疟原虫18S rDNA基因变异较小,基因型别较为稳定,均无明显种内差异.
关键词:疟原虫18S rDNA基因系统发生分析基因分型
分类号:R184.3(流行病学与防疫)
资助基金:国家科技重大专项(2017ZX10103007-001)
论文发表日期:2019-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 177-180 )
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ISSN:1671-2781
年,卷(期):2019,25(2)
所属栏目:生态研究