长春市双阳地区鼠类携带的汉坦病毒基因序列分析
孙宇1
孙炳欣1
沈博2
吴静1
1.长春市疾病预防控制中心,吉林长春,1300332.吉林省疾病预防控制中心,吉林长春,130062
摘要:目的 研究长春市双阳区鼠类中汉坦病毒感染情况及其基因分型.方法 收集2011年双阳地区捕获鼠类,取鼠肺组织,用间接免疫荧光检测,阳性标本进行汉坦病毒M片段扩增并测序,与其他毒株进行相似性比对及系统树分析.结果 收集100份鼠肺,经IFA检测到1份阳性,阳性率为1%,对其进行逆转录巢式PCR扩增,结果为汉城(SEO)型HV,与代表株进行相似性比较发现,SY-4部分M基因片段序列与其他SEOV核苷酸相似性为95.4% ~ 99.7%,氨基酸序列相似性为99%~ 100%.系统树显示,该序列属S3亚型.结论 本次获得HV是SEO型,亚型为S3亚型.
关键词:汉坦病毒核酸检测基因分型系统发生分析
分类号:S443(动物危害及其防治)
论文发表日期:2016-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
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ISSN:1671-2781
年,卷(期):2016,22(3)
所属栏目:生态研究