基孔肯雅病毒感染中微小RNA-信使RNA负调控网络构建及潜在治疗药物筛选
唐育杰1
赵鹏1
侯传东2
张昊军1
孙鑫2
黄磊3
卢学春4
1.山西医科大学管理学院,太原 0306002.中国人民解放军总医院第二医学中心血液科国家老年疾病临床医学研究中心(解放军总医院),北京 1008533.中国人民解放军总医院第五医学中心感染病医学部国家感染性疾病临床医学研究中心,北京 1000394.山西医科大学管理学院,太原 030600;中国人民解放军总医院第二医学中心血液科国家老年疾病临床医学研究中心(解放军总医院),北京 100853;临床决策研究大数据山西省重点实验室,太原 030600
摘要：目的 本研究基于公开的基孔肯雅病毒(CHIKV)多组学数据库,整合多组学分析方法,揭示CHIKV感染过程中微小RNA(miR)的调控机制,并预测CHIKV感染的潜在治疗药物.方法 通过分析基因表达综合数据库中多个数据集(GSE49985、GSE49884、GSE143390),使用R语言limma包鉴定差异表达信使 RNA(DEmRNA)和差异表达 miR(DEmiR).利用 miRTarBase、miRDB 和 TargetScanHuman 数据库预测DEmiR的靶基因,构建CHIKV感染的miR-mRNA负调控网络.最后,基于EpiMed平台、Connectivity Map数据库和高通量虚拟筛选预测潜在治疗药物.结果 研究鉴定了 1 134个DEmRNA和54个DEmiR;基因本体论分析结果显示,DEmRNA显著参与细胞周期、染色体分离、蛋白质折叠等生物学过程;京都基因与基因组百科全书分析结果显示,DEmRNA在病毒感染、蛋白质加工、溶酶体和神经退行性疾病等通路中富集.miR-mRNA负调控网络包含29对上调miR-下调mRNA和90对下调miR-上调mRNA;利用Cytoscape软件的cytoHubba插件中的最大团中心性算法筛选预测的靶基因,构建子调控网络.通过药物预测,EpiMed平台识别出94种候选药物,Connectivity Map数据库筛选出2 907种候选药物,经过高通量虚拟筛选进行综合评估,最终确定氯硝西泮、奈韦拉平、伊曲康唑、匹美克莫司和美洛昔康等5种与CHIKV感染典型临床症状相关的潜在治疗药物.结论 本研究构建了 CHIKV感染相关miR-mRNA负调控网络并筛选关键基因,进一步结合药物重定位与虚拟筛选预测5种潜在候选药物,为CHIKV靶向干预提供了系统生物学线索与候选资源.
关键词：基孔肯雅病毒微小RNA-信使RNA调控网络分子对接药物预测药物重定位
分类号：R373(医学微生物学（病原细菌学、病原微生物学）)
论文发表日期：2026-04-18
在线出版日期：2026-09-14（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 547-551 )
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