探究DNA提取过程中消化时间对FFPE DNA质量的影响
张科平
许洁
赵盼盼
黄泳军
南方医科大学附属广东省人民医院(广东省医学科学院)病理科,广州 510080
摘要：目的 探讨甲醛固定石蜡包埋(FFPE)样本中DNA提取过程中,裂解消化步骤的时间长度对最终DNA质量的影响.方法 选取一块尺寸为1 cm×1 cm×0.3 cm的新鲜扁桃体组织样本,在4%中性甲醛溶液中固定24 h后,通过脱水及包埋处理,并连续切片得到50张未染色玻片.将这些玻片分为ABCDE五组,依次标记为A1至A5、B1至B5等.其中,A组采用标准消化程序(即56℃过夜消化约16 h),而B、C、D、E 4组则分别消化时间为24 h、48 h、72 h以及7天.随后从所有样本中提取DNA并测定其浓度与光密度比值(OD值),以此评估DNA的质量和完整性.结果 随着消化时间的增加,FFPE来源的DNA浓度呈现上升趋势;然而,消化时长对于提高DNA纯度的效果并不明显;值得注意的是,长时间消化反而会导致DNA完整性的下降;尽管如此,经过长达一周消化处理后的FFPE DNA仍可作为后续如新一代测序技术(NGS)等分析的有效材料.结论 在从FFPE标本中分离DNA时,合理控制消化阶段的时间是至关重要的,以确保获得高质量的DNA,从而提升后续实验检测的准确性.
关键词：甲醛固定石蜡包埋(FFPE)DNA提取蛋白酶K裂解消化
论文发表日期：2025-10-28
在线出版日期：2025-11-06（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：3( 1376-1378 )
英文信息