新疆汉族食管鳞癌差异表达长链非编码RNA的筛选与分析
李光华
郑勇
史贵军
方春晓
程丽云
齐翠花
陈卫刚
1.石河子大学医学院第一附属医院消化内科, 新疆维吾尔自治区石河子市,8320002.石河子大学医学院第一附属医院消化内科, 新疆维吾尔自治区石河子市,8320003.石河子大学医学院第一附属医院消化内科, 新疆维吾尔自治区石河子市,8320004.石河子大学医学院第一附属医院消化内科, 新疆维吾尔自治区石河子市,8320005.石河子大学医学院第一附属医院消化内科, 新疆维吾尔自治区石河子市,8320006.石河子大学医学院第一附属医院消化内科, 新疆维吾尔自治区石河子市,8320007.石河子大学医学院第一附属医院消化内科, 新疆维吾尔自治区石河子市,832000
摘要：目的:全基因组关联分析食管癌组织中长链非编码RNA(lncRNA)表达水平的改变及其意义.方法:通过基因芯片技术筛选了6对食管癌及其癌旁正常组织中差异表达的lncRNA和mRNA,通过靶基因预测,利用基因本体论(GO)和Pathway进一步分析lncRNA的功能.结果:差异表达(2倍以上变化且P<0.05)lncRNA共680个,其中161个lncRNA表达上调,519个lncRNA表达下调;差异表达mRNA共1472个,其中653个mRNA上调,819个mRNA下调.GO和通路分析表明这些差异表达基因参与11条可能与食管鳞癌相关的通路,包括翻译后蛋白修饰调节,粘蛋白O型聚糖的生物合成和鞘糖脂代谢途径等通路,主要涉及分子功能、细胞成分和生物过程的改变.通过顺式和反式调控分析发现共有11个lncRNA有cis-调控的靶基因,1个lncRNA有trans-调控的靶基因,3个lncRNA同时有cis-和trans-调控的靶基因.结论:与癌旁正常组织相比,新疆汉族食管癌组织中lncRNA的表达水平明显改变,差异表达的lncRNA可能通过某些信号通路参与食管癌的发生发展,对进一步寻找食管鳞癌诊断和治疗相关的新的靶点具有重要意义.
关键词：食管鳞癌长链非编码RNA信使RNA靶基因预测
资助基金：国家自然科学基金(81260362)
论文发表日期：2017-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 1805-1810 )
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