基于转录组测序的候选膀胱尿路上皮癌分子标记的识别
肖四方
张应爱
肖敬川
曹卉
张淑芳
1.中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室, 海口市,5702082.中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室, 海口市,5702083.中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室, 海口市,5702084.中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室, 海口市,5702085.中南大学湘雅医学院附属海口医院中心实验室, 海口市,570208
摘要:目的:探讨基于Illumina平台的转录测序筛选出的膀胱癌的候选分子标记物在临床诊断中的可能应用价值。方法:对中南大学湘雅医学院附属海口医院2011-2013年31例膀胱尿路上皮癌和对应的正常组织,采用实时荧光定量PCR对转录组测序筛选出的候选基因进行验证。结果:筛选出的4个候选基因, CDH1、CLDN7、VEGFA和PTPRF在转录组测序患者肿瘤组织相对于正常组织表达上调;实时荧光定量PCR对更多的患者验证发现,CDH1、VEGFA、PTPRF和CLDN7中,VEGFA相对表达水平上调,差异有统计意义(P<0.05),VEGFA和PTPRF表达相对上调,但差异无统计学意义(P>0.05);PTPRF和肿瘤的初发和复发关系比较密切(P=0.002),其预测敏感度和特异度分别为90.0%和83.3%。结论:VEGFA在膀胱尿路上皮癌的发生发展中起重要作用,有望成为膀胱尿路上皮癌的分子标志物,PTPRF有望作为预测膀胱肿瘤复发的分子参考指标。
关键词:膀胱肿瘤转录组测序分子标记物实时荧光定量PCR
资助基金:海南省自然基金资助项目(编号813256)海口市重点资助项目(编号2012-073)
论文发表日期:2014-01-01
在线出版日期:2025-08-15(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 1745-1749 )
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