萨福克和湖羊杂交F1代与湖羊背最长肌转录组分析
成伟伟1
杨军祥1
徐建峰1
王燕燕1
王珂1
董和1
高登伟2
崔光亚3
1.甘肃省畜牧兽医研究所,甘肃平凉7440002.环县畜牧技术推广中心,甘肃环县7450003.驻马店华中正大有限公司,河南驻马店463000
摘要：试验比较分析萨福克与湖羊杂交F1代和湖羊纯繁羔羊背最长肌差异表达基因转录组,探索影响萨湖F1代和湖羊肉质的重要基因和关键代谢通路.采集10月龄萨福克与湖羊杂交F1代羔羊(SH)和湖羊纯繁羔羊(HH)背最长肌组织,利用RNA-seq技术进行基因转录组比较分析,差异表达基因qRT-PCR验证.结果显示:筛选出差异基因322个,得到GO数据库注释278个,参与生物过程(BP)、分子功能(MF)和细胞组成(CC)的分别为83、140和55个.得到KEGG数据库注释147个,参与216条通路,差异基因显著富集通路24条.通过查阅文献和对比分析,初步认为与肉质相关的通路为氨基酸的生物合成通路、甘油酯代谢通路、PPAR信号通路、MAPK信号通路和肌动蛋白细胞骨架的调节通路.筛选出与肉质相关的候选基因有LPIN1、CFL2、ENO3和AQP7.研究表明,在转录组水平上筛选出萨福克与湖羊杂交F1代、湖羊纯繁羔羊背最长肌差异表达基因322个,初步认为与肉质可能相关的通路11条,与肉质相关的候选基因4个.
关键词：萨福克与湖羊杂交F1代湖羊纯繁羔羊背最长肌转录组比较分析
分类号：S826(家畜)
资助基金：基因项目(GSLK-2020-8)甘肃省青年科技基因计划项目(21JR7RA719)甘肃省畜牧兽医研究所创新项目(GNKJ-2020-9)
论文发表日期：2022-05-15
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 95-99 )
英文信息