基于16S rRNA基因测序分析食管鳞癌患者食管菌群分布特征
孔金玉1
刘安祥2
刘怡文3
钱梦凡3
李婧雅3
李若楠3
邢玲4
周福有2
韦波5
高社干1
1.河南科技大学第一附属医院,河南省肿瘤表观遗传重点实验室,河南省微生态与食管癌防治重点实验室,中国洛阳,471023;河南科技大学信息工程学院,河南洛阳,4710232.河南科技大学附属安阳市肿瘤医院,河南省食管癌精准防治医学重点实验室,河南安阳,4550003.河南科技大学第一附属医院,河南省肿瘤表观遗传重点实验室,河南省微生态与食管癌防治重点实验室,中国洛阳,4710234.河南科技大学信息工程学院,河南洛阳,4710235.湖南港湾科学仪器有限公司,湖南湘潭,411100
摘要：目的 描述食管鳞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)患者癌组织和邻近癌旁组织食管菌群组成和结构特点,筛选两组差异性菌群.方法 收集安阳市肿瘤医院48例经病理学确诊的原发性ESCC的癌组织和邻近癌旁组织,对16S rRNA基因的5个变异区(V2、V3、V5、V6、V8)进行测序,采用Wilcoxon秩和检验比较两组菌群Alpha多样性及相对丰度差异.结果 与癌旁对照组相比,ESCC癌组织Alpha多样性升高.厚壁菌门、拟杆菌门、变形菌门和梭杆菌门是ESCC组及癌旁对照组的主要菌门.和癌旁对照组相比,ESCC组含有较高丰度的梭杆菌门及螺旋菌门,较低丰度的放线菌门和蓝藻门(P＜0.05).属水平上,ESCC组梭杆菌属、嗜二氧化碳噬纤维菌属、卡氏菌属和密螺旋体属菌群丰度显著高于癌旁对照组,而葡萄球菌属和微单胞菌属丰度低于癌旁对照组(P＜0.05);种水平上,ESCC组具核梭杆菌、牙周梭杆菌、生痰二氧化碳嗜纤维菌和牙龈卟啉单胞菌等丰度高于癌旁对照组,而异乳链球菌和鞘氨醇单胞菌丰度低于癌旁对照组.结论 ESCC患者肿瘤和邻近正常肿瘤组织样本的食管微生物组成存在显著差异.
关键词：食管鳞状细胞癌食管菌群16S rRNA
分类号：R735.1(消化系肿瘤)
资助基金：河南省医学科技攻关计划项目(SBGJ202103099)河南省医学科技攻关计划项目(SBGJ202103100)
论文发表日期：2024-09-30
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 170-177 )
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