基于加权基因共表达网络鉴定食管癌浸润性淋巴细胞关键节点基因
侯永杰
曹恒
杨海军
周福有
安阳市肿瘤医院,河南安阳,455000
摘要：目的 分析食管癌肿瘤浸润性淋巴细胞抗原受体区的基因表达,利用加权基因共表达网络分析(weighted gene co-expression network analysis,WGCNA)方法筛选食管癌的关键基因,为相关研究提供数据支撑.方法 选择安阳市肿瘤医院70例食管癌患者的组织标本进行基因测序,同时,从NCBI SRA数据库下载部分转录组数据.通过R语言的WGCNA模块构建食管癌共表达网络,并鉴别与食管癌关联性最强的共表达模块,关键基因由Centiscape筛选.结果 网络分析的结果表明,MEgrey60、MEpurple和MEblack模块与食管癌高度相关.依据蛋白—蛋白相互作用关系,本研究从每个模块中筛选了关联度最高的20个关键基因.这些模块中的基因主要涉及内肽酶抑制剂活性和特异性RNA聚合酶Ⅱ转录因子活性、组蛋白结合、抗氧化活性、硫氧还蛋白过氧化物酶活性、ATP酶活性和蛋白质转运蛋白活性等生物学功能.结论 本研究筛选出的食管癌浸润性淋巴细胞的关键基因,可为食管癌的诊断、治疗和免疫治疗提供靶点和理论依据.
关键词：食管癌WGCNA靶点节点基因肿瘤浸润淋巴细胞
分类号：R735.1(消化系肿瘤)
资助基金：河南省科技攻关项目(212102310718)安阳市科技攻关项目(2022C01SF036)
论文发表日期：2024-06-30
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 141-147 )
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