共表达网络鉴定食管鳞癌中抗肿瘤细胞毒性分子
李孟祥1
陈攀2
杜玉博2
张自超2
孙魁2
冯笑山2
高社干2
齐义军2
1.洛阳理工学院数学与物理教学部,河南洛阳,471023;河南科技大学第一附属医院,肿瘤医院,省部共建食管癌防治国家重点实验室,河南省微生态与食管癌防治重点实验室,河南省肿瘤表观遗传重点实验室,中国洛阳,4710032.河南科技大学第一附属医院,肿瘤医院,省部共建食管癌防治国家重点实验室,河南省微生态与食管癌防治重点实验室,河南省肿瘤表观遗传重点实验室,中国洛阳,471003
摘要：目的 鉴定新的抗食管鳞癌(ESCC)免疫细胞毒性相关分子.方法 基于ESCC转录组表达谱数据,利用CIBERSORT反卷积算法计算ESCC样本中免疫细胞构成比;通过加权基因共表达网络分析(WGCNA)构建基因模块;计算免疫细胞构成比与细胞毒性基因、共表达网络模块的相关性,确定关键模块.通过基因的模块隶属度、基因显著性和预后相关性,鉴定关键基因.结果 WGCNA方法共构建30个基因模块,其中white模块包含了本研究纳入的所有细胞毒性相关基因(GZMA、PRF1、GZMB和IFNG),将其作为关键模块.关键模块共包含18个关键hub基因,其中8个基因表达异常与ESCC患者预后相关.结论 通过基因共表达网络方法,鉴定到8个ESCC细胞毒性相关基因.
关键词：食管鳞癌基因共表达网络免疫细胞毒性
分类号：R735.1(消化系肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(U1604191)国家自然科学基金(81872037)
论文发表日期：2023-03-30
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 11-18 )
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