SNP rs951781影响食管癌患者的术后生存
孙琳1
宋昕2
魏梦霞2
赵学科2
徐瑞华2
李贝2
范宗民2
韩雪娜2
陈亚杰1
钟侃2
乔佳欣1
马琳琳1
谢叶真2
王立东2
1.郑州大学第一附属医院省部共建食管癌防治国家重点实验室,河南郑州,450052;郑州大学基础医学院病理学与病理生理学教研室,河南郑州4500522.郑州大学第一附属医院省部共建食管癌防治国家重点实验室,河南郑州,450052
摘要:目的 探讨巢蛋白(NES)基因单核苷酸多态性(SNP)位点rs951781对食管癌进展和预后的影响.方法 对来自高发地区医院的199例食管癌患者的癌组织和癌旁配对组织,采用全外显子测序(WES)方法检测NES-rs951781基因SNP,比较不同SNP型(野生型纯合子CC型、突变型杂合子CT和突变型纯合子TT)分布频率,并用K-M曲线比较不同SNP型患者的生存期,用表达数量性状基因座(eQTL)技术对其进行功能注释.结果 NES-rs951781存在SNP,野生型纯合子CC型占79.40%,突变型杂合子CT型占18.60%,突变型纯合子TT型占2.01%;野生型纯合子CC型的0.5、1、1.5 a生存率(87.97%、71.52%、58.23%)均低于突变型纯合子TT型.NES-rs951781对β-肌动蛋白(ACTB)的转录表达水平有trans-eQTL作用,使ACTB蛋白表达下调(beta=-0.43).结论 NES-rs951781位点TT基因型患者生存最好;NES-rs951781可能通过下调ACTB蛋白表达影响食管癌的发生发展.
关键词:单核苷酸多态性食管癌β-肌动蛋白全外显子测序生存分析
分类号:R735.1(消化系肿瘤)
资助基金:国家自然科学基金(81872032)
论文发表日期:2022-03-30
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 1-4 )
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