直接PCR法在口腔牙龈卟啉单胞菌检测中的应用
谷变利1
王娟萍2
孔金玉1
刘雅莉3
张灏4
詹启敏5
高社干1
1.河南科技大学临床医学院,河南科技大学第一附属医院,河南科技大学肿瘤研究所,河南省肿瘤表观遗传重点实验室,河南洛阳4710032.河南科技大学第一附属医院健康管理中心,河南洛阳4710033.河南省医学情报研究所,河南郑州4500464.暨南大学医学院,肿瘤精准医学与病理研究所,广东广州5106325.中国医学科学院北京协和医学院肿瘤研究所,分子肿瘤学国家重点实验室,北京100021
摘要：目的 为了便于食管癌大规模流行病学筛查工作的开展,探讨一种能快速敏感地检测口腔牙龈卟啉单胞菌(Porphyromonas gingivalis,P.gingivalis)DNA的免核酸抽提直接PCR方法.方法 收集我院门诊100例体检人员的200份口腔拭子(每人双份),以TE buffer(10 mM Tris,0.1 mM EDTA,pH 8.0)、商品化裂解液以及核酸抽提试剂盒等作为基因组提取试剂,使用P.gingivalis特异引物探针进行直接定量PCR检测.结果 与裂解液-直接qPCR法相比,TE-直接qPCR法的灵敏度为94.12％,特异性为100％;与试剂盒-qPCR法相比,TE-直接qPCR法的灵敏度与特异性均为100％;TE-直接qPCR法与裂解液-直接qPCR法以及与试剂盒-qPCR法检测P.gingivalis均具有高度一致性(分别为Kappa=0.954,Kappa=1);TE-直接qPCR法与试剂盒-qPCR法检测阳性P.gingivalis的Ct均值无显著差异(P=0.907).结论 TE-直接qPCR法检测口腔P.gingivalis灵敏度高、特异性强,是快速高效检测口腔P.gingivalis的理想方法,可用于食管癌大规模分子流行病学研究.
关键词：食管癌牙龈卟啉单胞菌直接PCR分子流行病学
分类号：R-331(实验医学、医学实验)
资助基金：国家自然科学基金(81972571)河南省卫健委联合共建项目(2018020299)
论文发表日期：2020-03-30
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 38-42 )
英文信息