慢性移植肾肾病患者外周血差异表达基因的分析
徐洪来1
肖敏2
杨超1
高义1
雒真龙1
周鸿敏1
陈忠华1
1.华中科技大学同济医学院附属同济医院器官移植研究所,武汉,4300302.华中科技大学同济医学院附属协和医院皮肤科,武汉,430022
摘要：分析慢性移植肾肾病(CAN)患者与移植物功能稳定肾移植受者外周血基因表达差异,探索CAN免疫致病机制.从GEO数据库获取GSE12187和GSE22229两个肾移植受者外周血的基因芯片表达谱数据集,选取其中13个CAN样本为实验组,15个移植物功能稳定的样本为对照组.以SAM筛选两组样本的差异表达基因.应用DAVID及GENECODIS网络工具对差异基因进行功能富集分析.通过Cytoscape软件的MiMI插件进行差异基因的蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析.SAM筛选出上调基因168个,下调基因141个.基因富集结果显示,上调基因主要为调控转录和翻译过程的基因,而下调基因参与广泛信号传导通路以及基因表达的调控.Cytoscape软件的PPI分析筛选出19个CAN相关核心基因.CAN患者与移植肾功能稳定受者的免疫功能状态存在显著差异；CAN致病机制涉及免疫细胞复杂的基因表达调控及细胞增值、凋亡、迁移等广泛的信号传导通路变化；免疫细胞在基因的转录、RNA加工、翻译及蛋白质代谢等环节的改变可能在CAN的致病中发挥了关键作用；TAGAP、EIF3F、NUDT21、PAPOLA、RPL等CAN核心基因的免疫调控机制需要深入探索.
关键词：肾移植慢性移植肾肾病基因表达谱基因富集蛋白质相互作用
分类号：R318(医用一般科学)R392.4(医学免疫学)R692.6(泌尿科学（泌尿生殖系疾病）)Q811.4(仿生学)
资助基金：国家重点基础研究发展计划（973计划）(2009CB522407)
论文发表日期：2013-01-01
在线出版日期：2026-09-11（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 16-21 )
英文信息