小鼠心脏发育相关基因调控网络的生物信息学分析
张慧
陆祖宏
1.东南大学生物电子学国家重点实验室,南京,2100962.东南大学生物电子学国家重点实验室,南京,210096
摘要：Nkx2.5,Mef2c,Gata4/5/6,Tbx5和Hand1等基因作为脊椎动物心脏发育相关基因调控网络的核心基因,对脊椎动物的心脏发育起核心调控作用.本研究主要通过对小鼠心脏发育相关核心基因的生物信息学分析,研究Nkx2.5,Mef2c,Gata4,Gata6,Tbx5和Hand1等核心转录因子之间的相互调控关系,得到小鼠心脏发育的核心基因调控网络(GRNs).与文献中总结的小鼠的GRNs作比较,发现Nkx2.5在小鼠心脏发育基因调控网络中的核心地位没有改变,并且Nkx2.5在网络中主要扮演了调控者的角色,它直接调控很多转录因子.Gata4是另一个主要起调控者作用的转录因子.另外小鼠的Mef2c和Hand1处于被多个转录因子调控的地位.变化比较大的是Tbx5所涉及的调控网络,主要有两点:Nkx2.5对Tbx5的表达有没有调控作用以及Tbx5对自身的表达有没有调控作用.研究表明生物信息学分析对具体实验研究有一定方向性指导意义.
关键词：小鼠心脏发育基因调控网络生物信息学转录因子
分类号：R318(医用一般科学)
论文发表日期：2011-01-01
在线出版日期：2026-09-11（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 95-100 )
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