ASPP2基因启动子区DNA甲基化及转录因子DNA结合位点的干湿研究
孙倩
王进科
1.东南大学生物电子学国家重点实验室,南京,2100962.东南大学生物电子学国家重点实验室,南京,210096
摘要：对p53凋亡刺激蛋白2 (ASPP2)基因启动子区进行了甲基化及转录因子结合位点(TFBS) 的生物信息学分析及实验研究.结果表明,在该基因近端启动子区存在一个长1391bp的CpG岛,且此区域中包含19个转录因子的37个结合位点,其中有13个转录因子的结合位点含有CpG;甲基化预测发现在含CpG的23个TFBS中有18个位点的CpG易发生甲基化.由此推断ASPP2是典型的多因子调控的CpG岛基因,CpG岛的异常甲基化将影响转录因子结合,导致ASPP2基因表达下调.通过对人肝癌细胞株HepG和人成纤维细胞HFL-1的ASPP2基因启动子CpG岛中含4个E2F结合位点区域的甲基化实验检测,证明这种推断是正确的.这一研究说明,对重要基因启动子区DNA甲基化及TFBS的生物信息学研究可为相关的实验研究提供指南,对促进基因表达的表观遗传调控研究具有重要意义.
关键词：ASPP2DNA甲基化转录因子结合位点生物信息学分析DNA测序
分类号：R318(医用一般科学)
资助基金：国家自然科学基金(60871014)
论文发表日期：2010-01-01
在线出版日期：2026-09-11（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 254-258,267 )
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