MHC-Ⅱ类抗原表位预测软件的对比评价
李胜涛
刘昌文
邹泽红
陶爱林
1.广州医学院第二附属医院,广州,5102602.广州医学院第二附属医院,广州,5102603.广州医学院第二附属医院,广州,5102604.广州医学院第二附属医院,广州,510260
摘要：比较不同MHC-Ⅱ类抗原表位预测软件的优缺点,为后续应用提供依据.在众多HLA-Ⅱ类抗原表位中,选取HLA-DR的6个表位(DRB1*0101, 0301, 0401, 0701, 1101和1501)为代表,选取MHCBN数据库中的309条已知抗原表位的肽链为待测肽链.使用近年来常用的7个表位预测软件,根据不同软件的临界值确定入选结果数据,比较各软件所得结果与已有的实验结果之间的差距以确定其优劣.综合7个软件预测结果进行评价,得出NetMHCⅡ和NetMHCⅡpan所得结果准确率最高.可以用NetMHCⅡpan及NetMHCⅡ进行MHC-Ⅱ类分子抗原表位预测.不同软件HLA的各个亚型的预测所得指标不一致,提示综合运用不同软件对多肽表位进行预测十分必要.
关键词：MHC-Ⅱ表位预测临界值软件比对
分类号：R318(医用一般科学)
资助基金：国家自然科学基金资助项目(30640033、30771240)广东省自然科学基金重点项目(8251018201000002)广州市属高校科研教学团队项目(B94118)广东省医学科研项目(A2007272)
论文发表日期：2010-01-01
在线出版日期：2026-09-11（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 128-132 )
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