基于K近邻的蛋白质功能的预测方法
倪青山
王正志
黎刚果
孟祥林
1.国防科技大学机电工程与自动化学院,湖南,长沙,4100732.国防科技大学机电工程与自动化学院,湖南,长沙,4100733.国防科技大学机电工程与自动化学院,湖南,长沙,4100734.国防科技大学机电工程与自动化学院,湖南,长沙,410073
摘要：蛋白质功能预测是后基因组时代研究的重要问题之一.利用蛋白质相互作用网络,提出了一种基于K近邻的蛋白质功能的注释方法,该方法首先计算待注释的蛋白质与所有已知功能的蛋白质间的注释环境相似度,选择其中最相似的K个蛋白质,将该K个蛋白质的功能注释进行加权平均,作为待注释的蛋白质最终的功能注释.在构建的芽殖酵母的两组大规模相互作用数据集上的测试表明,该方法能够有效的对蛋白质功能进行预测,在蛋白质功能预测性能上优于现有的一些方法.
关键词：蛋白质相互作用蛋白质功能预测K近邻算法相似性加权方法
分类号：Q811(仿生学)TP391(计算技术、计算机技术)R318(医用一般科学)
资助基金：国家自然科学基金(60471003)
论文发表日期：2009-01-01
在线出版日期：2026-09-11（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 87-90 )
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