基于结构信息的RNA多序列比对
赵英杰
王正志
1.国防科技大学机电工程与自动化学院,长沙,4100732.国防科技大学机电工程与自动化学院,长沙,410073
摘要:本研究提出了一种考虑了结构信息的同源RNA多序列比对算法,它先利用热力学方法计算出每条序列的配对概率矩阵,得到结构信息,由此构造各条序列的结构信息矢量,结合传统序列比对方法,提出优化目标函数,采用动态规划算法和渐进比对得到最后的多序列比对.试验证实了该方法的有效性.
关键词:多序列比对RNA二级结构配对概率矩阵结构信息矢量动态规划
分类号:R318(医用一般科学)
资助基金:国家自然科学基金(60471003)
论文发表日期:2009-01-01
在线出版日期:2026-09-11(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:5( 1-5 )
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生物医学工程研究

生物医学工程研究

北大核心CSTPCD
ISSN:1672-6278
年,卷(期):2009,28(1)
所属栏目:论著