结合消减杂交筛选肝癌细胞系中差异甲基化位点
樊红1
程欲超2
赵主江
权艳梅
成建
1.东南大学"发育与疾病相关基因"教育部重点实验室,江苏,南京,2100092.东南大学医学院遗传与发育生物学系,南京,210009
摘要:为探索有效分离两样品间差异甲基化片段的方法,以DNMT1(DNA methyltransferase 1,DNMT1)表达抑制前后的肝癌细胞系7721-sMT1和7721-pMT1为研究对象,结合消减杂交和磁珠分离的方法,在两细胞系全基因组DNA范围内进行扫描差异性甲基化片段;将这些片段进行生物信息学分析,发现所获38条差异甲基化片段分布于不同的染色体上,但集中于重复序列、基因的启动子区,此特点符合DNA甲基化位点分布规律.实验结果证明消减杂交结合磁珠分离的方法,能筛选出两样品间的差异甲基化片段,该方法的建立为筛选肿瘤细胞中特异性差异甲基化片段作为肿瘤诊断的标志物提供了可能性.
关键词:消减杂交DNA甲基化差异甲基化片段表观遗传学CpG岛DNMT
分类号:R318(医用一般科学)
资助基金:国家自然科学基金(30470950)
论文发表日期:2006-01-01
在线出版日期:2026-09-11(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:4( 154-157 )
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