氨基酸非键作用指数用于HLA-A*0201限制性CTL表位定量预测研究
张梦军1
周鹏2
李声时2
肖正华1
邓金1
1.第三军医大学医学检验系分析化学教研室,重庆,4000382.湖南大学化学生物传感与计量学国家重点实验室,长沙,410082;重庆大学化学化工学院,重庆,400044
摘要：目的 预测SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位.方法 从分子的三维空间结构出发,基于静电、立体、疏水这三类与生物活性直接相关的非键作用方式,经主成分分析技术(PCA)得到了一种新的分子结构表达方法--氨基酸非键作用指数.利用该指数结合偏最小二乘(PLS)算法对152个HLA-A*0201限制性CTL表位进行了定量构效关系(QSAR)建模,再使用该模型对SSX-1和SSX-4抗原HLA.A*0201限制性表位进行预测.结果 预测出8个活性值大于7的九肽表位.结论 通过对SSX-1和SSX-4抗原HLA-A*0201限制性表位的预测,从而为SSX-1和SSD-4抗原HLA-A*0201限制性表位的实验探测和鉴定打下了基础.
关键词：SSX-1SSX-4氨基酸非键作用指数HLA-A*0201CTL表位定量构效关系
分类号：O641.12(物理化学（理论化学）、化学物理学)
资助基金：教学改革项目(XG200511)
论文发表日期：2007-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 440-444,448 )
英文信息