癌胚抗原低亲和力表位改造中的分子对接
支轶
吴玉章
万瑛
邹丽云
郭晟
刘娜
1.第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,4000382.第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,4000383.第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,4000384.第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,4000385.第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,4000386.第三军医大学全军免疫学研究所,重庆,400038
摘要：目的通过分子对接方法筛选表位改造后的高亲和力CTL表位.方法在图形工作站上,将癌胚抗原来源的低亲和力表位及其N末端第一位残基以酪氨酸替换后的突变体,分别与MHC Ⅰ类分子进行对接,对接所得最佳构象进行600 ps分子动力学模拟修正.结果改造后的突变体与MHC分子间存在较强的氢键和疏水相互作用,组成肽结合槽口袋A的基Tyr7、Tyr171和Tyr159与多肽N末端形成稳定的氢键作用网络,并且P1位酪氨酸上的苯环可与Trp167上的苯环发生π-π堆积作用.结论分子对接模型预测的肽-MHC复合物作用模式,提示改造后的突变体与MHC Ⅰ类分子间具有更高的亲和力,与实验结果一致.
关键词：MHCⅠ类分子CTL表位分子对接分子动力学
分类号：R392.11(医学免疫学)
资助基金：国家重点基础研究发展计划(973计划)(2001CB510001)中国科学院资助项目(90208028)中国科学院资助项目(30490240)
论文发表日期：2005-01-01
在线出版日期：2025-08-15（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：4( 514-517 )
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