文冠果基因组无内含子基因生物信息学分析
刘欢龙1
陈玉琴2
1.河南科技大学 应用工程学院,河南 三门峡 4720002.三门峡职业技术学院,河南 三门峡 472000
摘要：对文冠果无内含子基因在不同染色体上的分布特征进行分析,并且研究了复制关系、KEGG富集及环境响应相关基因启动子区域中的顺式作用元件.结果表明,从文冠果基因组中鉴定出1 858个无内含子基因,占基因总数的7.40%.每条染色体上无内含子基因数量占染色体上基因总数的5.64%～9.07%,并且与该染色体长度及基因总数均存在正相关关系.基因染色体定位分析表明,无内含子基因更偏向分布于染色体的两端,而且超过90%的旁系同源对的Ka/Ks值小于1,说明文冠果无内含子基因在进化过程中主要经历纯化选择.无内含子基因的长度主要集中在201～1 400 bp,而且平均长度明显短于总基因平均长度.KEGG富集分析表明,文冠果无内含子基因主要参与环境信息处理过程,并且在与环境胁迫响应相关基因的启动子区域发现大量与植物激素响应及胁迫响应相关的顺式作用元件.
关键词：文冠果无内含子基因生物信息学信号通路启动子
分类号：S794.9(森林树种)
资助基金：河南科技大学应用工程学院高层次人才专项基金项目(SZYGCCRC-2021-010)
论文发表日期：2024-06-28
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 7-13 )
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