基于表达谱芯片数据的结直肠癌基因的生物信息学分析
郭晓敏
李春光
王平安
新乡市第二人民医院普通外科,河南新乡 453000
摘要：目的 通过对结直肠癌基因芯片数据进行生物信息学分析,筛选出结直肠癌与正常结肠组织细胞中的差异表达基因,寻找参与结直肠癌发生发展的关键基因,为探索结直肠癌的分子机制提供理论依据.方法 从GEO数据库获得结直肠癌基因表达数据集GSE10950、GSE41328、GSE74602,利用GE02R分析筛选差异表达基因,通过DAVID在线工具对差异表达基因进行GO分析和KEGG通路富集分析.利用STRING数据库对差异表达基因进行蛋白质相互作用网络分析,并筛选关键基因.利用GEPIA在线工具,查看上述筛选的差异基因在TCGA数据库中结直肠癌样本中的表达及预后.结果 共筛选出161个结直肠癌差异表达基因.经蛋白质互作网络分析筛选出8个核心差异表达基因,分别为CXCL8、CXCL1、CXCL2、CXCL12、ANPEP、CLCA4、CLCA1 和 GNG4.再用 GEPIA2 对差异表达基因进行分析,发现 CXCL8、CXCL2、GNG4在结直肠癌组织中的表达高于正常组织,CLCA1在结直肠癌组织中的表达低于正常组织.另外,GNG4在不同的结直肠癌分期中有差异,且在Ⅲ、Ⅳ期结直肠癌组织的表达高于Ⅰ、Ⅱ期.对上述基因进行生存分析,结果发现CXCL2、CLCA1表达量高的结直肠癌患者的生存率均高于其表达量低的患者,而GNG4表达量高的结直肠癌患者的生存率低于其表达量低的患者,差异有统计学意义(P＜0.05).结论 CXCL2、CLCA1、GNG4是结直肠癌预后的影响因素,CXCL2、CLCA1高表达的结直肠癌患者预后较好,GNG4高表达的结直肠癌患者预后较差.这对进一步研究结直肠癌发生和进展的分子机制及治疗靶点的筛选具有重要意义.
关键词：结直肠癌生物信息学基因芯片差异表达基因
分类号：R735.3(消化系肿瘤)
资助基金：河南省医学科技攻关计划联合共建项目(LHGJ20240829)
论文发表日期：2026-07-28
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：6( 2505-2510 )
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