细胞程序性死亡蛋白1在泛癌中的生物信息学分析
张战坡1
胡仁旺2
李丹2
兰奥峰2
1.联勤保障部队第九九○医院,河南驻马店 4630022.河南省人民医院胃肠外科,河南郑州 450003;郑州大学人民医院胃肠外科,河南郑州 450003
摘要：目的 探索细胞程序性死亡蛋白1(PDCD1)在泛癌中的生物信息学特征及与临床预后的相关性.方法 通过TCGA数据库下载33种常见肿瘤的基因表达谱信息、临床信息,并进行数据标准化处理,将PDCD1基因表达量高低与临床生存信息、免疫细胞浸润、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定性等多组学指标进行相关性分析;采用CIBERSOR免疫评分方法,研究在泛癌中的不同类型免疫细胞浸润量与PDCD1基因表达量高低的相关性;构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络图,筛选出与PDCD1共表达密切相关的蛋白编码基因,并进行KEGG和GO通路富集分析.提取33种肿瘤中细胞死亡相关基因(铁死亡、铜死亡、细胞焦亡)的表达情况,与PDCD1基因进行共表达相关性分析.结果 PDCD1基因在多种类型肿瘤组织中表达量高于正常组织,且影响患者的总生存期、无进展生存期、无病生存期和疾病特异性生存期,差异有统计学意义.PDCD1基因在泛癌中表达量与多种免疫细胞浸润量、肿瘤突变负荷、微卫星不稳定等具有相关性.PDCD1基因在多种类型肿瘤中与细胞死亡相关基因(铁死亡、铜死亡、细胞焦亡)存在共表达情况.筛选到与PDCD1基因密切相关的 10 个蛋白编码基因(PDCD1LG2、CD3D、CD247、HJA-DRB1、PTPN11、HLA-DQB1、CD4、CD80、CD274、CD3E),富集分析显示这些基因与PD-L1在癌症中的表达及PD-1检查点通路和细胞黏附分子通路等通路密切相关.结论 PDCD1可能成为多种类型肿瘤治疗的基因靶点.
关键词：细胞程序性死亡蛋白1泛癌TCGA数据库生物信息免疫治疗
分类号：R730.2(一般性问题)
资助基金：河南省医学科技攻关计划联合共建项目(LHGJ20220020)
论文发表日期：2025-06-13
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 1936-1943 )
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