基于GEO数据库鉴定免疫浸润相关的桥本甲状腺炎关键生物标志物靶点
刘俊锋
齐攀
新乡市中心医院/新乡医学院第四附属医院头颈乳腺科,河南新乡 453000
摘要:目的 本研究旨在通过生物信息分析探索桥本甲状腺炎(HT)的关键标志物和潜在分子机制,为HT治疗提供新思路.方法 GEO数据库获取GSE138198、GSE549586数据集,共纳入13例HT样本及10例对照样本;同时获取免疫相关基因1 618个.依次进行差异表达基因分析、韦恩分析、基因本体分析、京都基因与基因组通路富集分析、蛋白相互作用分析、基因集富集分析、LASSO回归分析、一致性聚类分析、免疫浸润分析等,进行重要标志物筛选.结果 病例组及对照组间共筛选出803个差异基因,其中538个在病例组上调,265个下调;其中包含免疫相关基因134个.通过蛋白相互作用分析、LASSO回归分析,最终筛选出3个免疫相关基因:TLR3、CCL5、CXCR5.依据3个特征基因的表达量,将HT样本分为2个亚型,发现两亚组间的基因表达水平、富集通路及免疫浸润水平差异有统计学意义.结论 本研究筛出的3个HT关键基因可对人群进行良好分层,有望成为新型治疗靶点.
关键词:桥本氏甲状腺炎免疫浸润靶点GEO
分类号:R581.4(内分泌腺疾病及代谢病)
论文发表日期:2025-06-13
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:9( 1925-1933 )
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