基于生物信息学分析三阴性乳腺癌对药物治疗反应的关键差异表达基因
霍丹丹1
张军慧2
邱建阁3
刘文静1
王萌1
李军涛1
赵二江1
1.郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院,河南郑州 4500082.河南省人民医院心脏中心/华中阜外医院/郑州大学华中阜外医院,河南省冠心病防治重点实验室/河南省心血管流行病学研究中心,河南郑州 4514643.郑州大学医学科学院,河南郑州 450003
摘要：目的 基于生物信息学方法,从分子层面研究三阴性乳腺癌(TNBC)细胞使用多西他赛化疗反应的差异表达基因(DEGs),为研究三阴性乳腺癌诊疗提供新的思路.方法 从美国国立生物技术信息中心(NCBI)的公共基因芯片数据库(GEO)中获取TNBC基因芯片数据集GSE70690,应用计算机编程语言(R语言)软件筛选DEGs,并利用DAVID在线数据库对该基因数据进行相关基因功能富集分析.应用String在线数据库构建蛋白-蛋白相互作用网络(PPI),筛选出多西他赛化疗反应的关键基因.结果 分析芯片数据,筛选出865个差异表达基因,其中上调差异基因395个,下调差异基因470个.基因本体(GO)功能分析及京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路分析结果显示,差异表达基因与DNA复制、细胞分裂有关,并富集在DNA复制信号通路上.通过构建PPI网络筛选得到了 CDK1、TOP2A和BRCA1是三阴性乳腺癌患者多西他赛化疗分子机制中的枢纽基因.结论 利用生物信息学方法筛选出TNBC化疗药物多西他赛3个枢纽基因和关键信号通路,为提升TNBC化疗效果提供新的理论依据.
关键词：三阴性乳腺癌生物信息学差异表达基因
分类号：R737.9(泌尿生殖器肿瘤)
资助基金：河南省医学科技攻关计划联合共建项目(LHGJ20200192)河南省医学科技攻关计划联合共建项目(LHGJ20190783)河南省科技攻关项目(242102310063)
论文发表日期：2025-01-29
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 193-197 )
英文信息