区分肺腺癌和肺鳞状细胞癌的潜在基因分析
朱德奇
卢建国
李宾
张劲草
王忠民
董成来
新乡医学院第一附属医院胸外科一病区,河南新乡 453100
摘要:目的 对非小细胞肺癌(NSCLC)潜在基因进行分析,寻找区分肺腺癌(LUAD)和肺鳞状细胞癌(LUSC)的相关基因,探索NSCLC诊断与治疗的更有效方法.方法 利用3个基因表达综合(GEO)数据库(GSE4882、GSE7339和GSE40275)分析LUAD和LUSC组织样本中的差异表达基因(DEGs),对DEGs进行基因本体(GO)富集分析并构建蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络来寻找关键枢纽基因.最后在临床样本中验证关键枢纽基因的差异表达.结果 在GSE4882、GSE7339和GSE40275数据集中发现22个LUAD和LUSC的DEGs,通过构建PPI网络发现了 6个关键枢纽基因(KRT18、RAN、NME1、NME2、MIF和CFB),进一步在肿瘤基因组图谱(TCGA)数据库中分析枢纽基因表达与生存之间的关系,发现KRT18可能是区分LUAD和LUSC的潜在基因,同时构建了 KRT18基因突变与LUAD和LUSC患者预后的风险预测模型.最后采用新乡医学院第一附属医院临床组织样本对KRT18表达进行验证.结论 KRT18可能是区分LUAD和LUSC潜在基因.
关键词:肺腺癌肺鳞状细胞癌KRT18生物信息分析
分类号:R734.2(呼吸系肿瘤)
论文发表日期:2024-04-30
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:6( 1353-1358 )
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