整合高通量数据探讨非小细胞肺癌组织中微小RNA-182-5p的潜在靶基因
杨达平1
黄婉英2
罗嘉嫄2
何娟2
1.广西贵港人民医院/广西医科大学第八附属医院病理科,广西贵港 5371002.广西医科大学第一附属医院病理科,广西南宁 530021
摘要:目的 探讨miR-182-5p在非小细胞肺癌(NSCLC)中的表达情况、潜在靶基因、临床意义以及作用机制.方法 通过联合高通量数据以及内部逆转录定量聚合酶链反应(RT-qPCR)数据的1 720个样本,整合分析miR-182-5p在NSCLC中的表达情况.绘制受试者工作特征(ROC)曲线和综合受试者工作特征(SROC)曲线以评估miR-182-5p鉴别NSCLC组织和正常肺组织的能力.应用miRWalk 3.0数据库在线预测miR-182-5p的潜在靶基因,对低表达的潜在靶基因进行基因本体论(GO)和京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析.使用STRING在线工具构建miR-182-5p潜在靶基因的蛋白互作网络.运用Spearman相关系数评估潜在靶基因与miR-182-5p表达的相关性.结果 与正常肺组织对比,miR-182-5p在NSCLC组织中呈高表达,标准化均数差(SMD)为1.33(0.93~1.74).miR-182-5p区分NSCLC和正常肺组织的曲线下面积(AUC)为0.95(0.92~0.96),敏感度为0.81(0.68~0.89),特异度为0.93(0.86~0.96).miR-182-5p与EPS15的表达水平存在负相关性(ρ=-0.235,P=0.001).结论 与正常肺组织相比,NSCLC组织中miR-182-5p高表达.EPS15有可能是miR-182-5p在NSCLC的新靶点.
关键词:微小RNA-182-5p非小细胞肺癌基因芯片RNA测序靶基因
分类号:R734.2(呼吸系肿瘤)
论文发表日期:2023-11-15
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:9( 3844-3852 )
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河南医学研究

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ISSN:1004-437X
年,卷(期):2023,32(21)
所属栏目:论著