乳头状肾细胞癌诊断和预后相关miRNA的生物信息学研究
王宁
刘昌伟
褚校涵
王晓甫
赵兴华
郝斌
许长宝
郑州大学第二附属医院泌尿外科,河南郑州 453000
摘要：目的 挖掘乳头状肾细胞癌(PRCC)诊断和预后相关miRNA,探索其临床意义.方法 通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库获取PRCC miRNA表达谱数据,包含miRNA-seq和临床数据.利用R语言筛选PRCC组织和正常组织差异表达miRNAs.通过单因素Cox、LASSO及多因素Cox回归分析筛选与预后相关的miRNAs,并绘制受试者工作特征(ROC)曲线评价与预后相关miRNAs诊断PRCC的准确度和敏感度.借助TransmiR和Genecards数据库预测miRNAs的转录因子.通过miRDB、TargetScan、miRTarBase数据库预测miRNAs靶基因,并借助DAVID数据库进行GO及KEGG富集分析.利用TIMER数据库分析靶基因表达与免疫细胞浸润水平的相关性.结果 PRCC组织与正常组织的差异表达miRNAs共163个,其中hsa-miR-34a及hsa-miR-551 b与PRCC预后相关,随着肿瘤进展,其表达下调,其高表达则PRCC患者总生存率更高.ROC曲线提示hsa-miR-34a诊断PRCC的曲线下面积(AUC)＞0.7,准确度更高.hsa-miR-34a的表达受TP53等44个转录因子的调控.功能富集分析显示hsa-miR-34a的靶基因参与细胞因子负调控、miRNAs与癌症通路等,且参与细胞因子负调控的靶基因PPP1R11及LGR4表达和PRCC多种免疫细胞的浸润水平相关.结论 hsa-miR-34a与PRCC诊断和预后相关,可作为PRCC诊断和预后评估的生物标志物.
关键词：乳头状肾细胞癌miRNA预后生物信息学
分类号：R737.11(泌尿生殖器肿瘤)
论文发表日期：2023-09-30
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 3275-3281 )
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