基于生物信息学筛选急性ST段抬高型心肌梗死相关分子标志物
余保瑞1
任静静2
常爱民2
石瑛3
1.阜外华中心血管病医院 高血压科,河南 郑州 4500002.郑州大学第三附属医院 检验科,河南 郑州 4500003.郑州大学第三附属医院 检验科,河南 郑州 450000;郑州大学 检验系,河南 郑州 450000
摘要：目的 利用生物信息学筛选急性ST段抬高型心肌梗死(STEMI)相关的潜在的分子标志物和治疗靶点.方法 从开源性基因表达数据库(GEO)获取STEMI相关芯片数据集GSE66360和GSE19339.利用R语言Limma包筛选差异表达基因(DEGs),使用韦恩图在线工具识别数据集共同的DEGs.利用clusterProfiler包对共同DEGs进行基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)信号通路分析;利用STRING数据库构建蛋白互作网络(PPI);采用Cytoscape(版本号3.9.1)软件对PPI进行可视化分析并筛选重要模块和关键基因.结果 通过对芯片数据集GSE66360和GSE19339进行综合分析,获得107个共同DEGs,包括81个表达上调基因和26个表达下调基因,其中,前10位的基因(IL-1β、ICAM1、FN1、vWF、PLAU、CXCL2、THBD、CCL20、CXCL3和CCRL2)均为表达上调基因;KEGG通路分析表明TNF信号通路、糖尿病并发症AGE-AGER信号通路和NF-κB信号通路是重要的通路.结论 监测白介素-1β等的动态变化,为预防STEMI发生提供了检测指标,同时也为STEMI的治疗提供了靶点和强有力的数据支持.
关键词：急性ST段抬高型心肌梗死生物信息学差异表达基因分子标志物
分类号：R542.2+2(心脏、血管（循环系）疾病)
资助基金：河南省医学科技攻关计划联合共建项目(LHGJ20200441)
论文发表日期：2023-05-31
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 1729-1733 )
英文信息