卵巢癌预后不良基因ATP6V1F、GINS1、GINS4的筛选
饶玉梅
王欣欣
郑州大学第一附属医院妇科,河南郑州 450052
摘要：目的 筛选卵巢癌预后不良的分子生物学标志.方法 从GEO数据库获得卵巢癌GSE14001、GSE14407数据集,用在线分析工具GEO2R、Venn筛选得到卵巢癌和正常卵巢组织差异表达基因(DEGs),对DEGs进行富集分析,构建蛋白互作网络(PPI),以及构建网络模块得到关键基因,利用Kaplan Meier plotter网站分析关键基因与卵巢癌患者总生存期之间关系,应用GEPIA数据库分析DEGs在卵巢和卵巢癌组织中表达,应用The Human Protein Atlas数据库获取筛选基因的免疫组化结果,对比它们在卵巢和卵巢癌组织间的表达差异.结果 得到211个DEGs,92个上调和119个下调.差异基因生物学过程主要涉及侧枝发芽的正向调控、乏氧反应、间充质-上皮细胞信号传导;细胞组分主要集中在质膜顶、细胞表面、细胞外外泌体等部位;分子功能主要涉及丝氨酸型内肽酶活性、金属内肽酶活性、受体活性等;信号通路富集于白细胞跨内皮细胞迁移、细胞黏附通路、癌症通路等信号通路.得到35个候选基因,其中14个基因高表达、8个基因低表达与患者总生存期相关(P＜0.05).其中ATP6V1F、GINS1、GINS4基因在卵巢癌组织中在RNA水平和蛋白质水平表达均高于正常组织(P＜0.05).GNB3在卵巢癌组织中RNA水平表达低于正常组织,而在蛋白质水平恰好相反(P＜0.05).结论 ATP6V1F、GINS1、GINS4有可能是卵巢癌预后不良的新分子标志物.
关键词：卵巢癌ATP6V1FGINS1GINS4生物信息学
分类号：R737.31(泌尿生殖器肿瘤)
资助基金：国家自然科学基金(82201787)河南省高等学校重点科研项目(18A310031)
论文发表日期：2023-05-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 1586-1593 )
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