通过GEO数据库筛选宫颈癌发生的相关基因
常爱民
任静静
石瑛
郑州大学第三附属医院 检验科,河南 郑州 450052
摘要：目的 利用数据库筛选宫颈癌致病的关键基因,探讨宫颈癌的发病机制.方法 从高通量基因表达数据库(GE O)下载宫颈癌相关的芯片数据GSE89657、GSE63678和GSE29570,利用GEO2R在线分析软件筛选出宫颈癌差异基因748个,分别对差异基因进行基因本体富集分析(GO)、京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路分析以及蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPI)分析.结果 3个数据库共呈现32个共同差异基因,分别为15个上调基因,17个下调基因.差异基因导入DAVID数据库发现与宫颈癌细胞调亡和基因表达负调控、癌症通路有关.发现10个差异基因成为PPI网络复合体中的中枢基因,其表达水平的改变与宫颈癌的不良预后有关.其中拓扑异构体酶Ⅱa(TOP2A)在宫颈癌的诊断中最为重要.结论 通过GE O数据库分析宫颈癌的基因芯片数据,获取与其预后密切相关的基因,为疾病的早期诊断提供分子水平上的参考依据.
关键词：宫颈癌GEO数据库差异表达基因生物信息学
分类号：R737.3(泌尿生殖器肿瘤)
资助基金：河南省医学科技攻关联合共建项目(LHGJ20200471)河南省医学科技攻关联合共建项目(LHGJ20200441)
论文发表日期：2023-03-31
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：5( 961-965 )
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