葡萄SWI3基因家族特征及表达模式分析
崔小月1
吕中伟1
尚泓泉1
马凯欣2
娄玉穗1
张柯1
鲁会冉1
吴文莹1
樊红杰1
1.河南省农业科学院 园艺研究所,河南 郑州 4500022.天津师范大学 生命科学学院,天津 300387
摘要:染色质重塑复合体SWI/SNF在植物生长发育和胁迫应答中起重要作用.采用生物信息学分析的方法,系统研究了葡萄SWI3基因家族的特性.结果表明,欧洲葡萄中鉴定出4个SWI3基因家族成员,分别为VvSWI3A、VvSWI3B、VvSWI3C和VvSWI3D,分布在葡萄的3条染色体上.理化性质分析结果显示,4个VvSWI3均属于酸性的亲水蛋白,具有细胞核定位.α-螺旋和无规则卷曲占蛋白质二级结构组成的86.59%~94.27%,为主要的组成结构.系统发育分析将VvSWI3分为4个亚族,每个亚族各包含1个成员.所有VvSWI3均含有SWIRM、SANT和SWIRM_assoc_1结构域,此外,VvSWI3D还额外包含1个ZZ型的锌脂蛋白(Zinc finger-ZZ type)结构域.4个VvSWI3基因结构相似,均含有5~8个内含子.共线性分析结果表明,进化过程中欧洲葡萄共经历了5次与VvSWI3家族有关的基因复制事件.VvSWI3基因家族的启动子区域存在数量不等的光响应、激素响应、胁迫响应及生长发育相关的响应元件,由此推测该家族基因可能参与葡萄生长发育、胁迫及激素响应的调控过程.通过qRT-PCR技术进行的表达分析显示,VvSWI3基因主要在葡萄叶片中表达,且均能对干旱、低温与高温胁迫做出响应;同时,在脱落酸、水杨酸、茉莉酸甲酯及乙烯利处理后,4个VvSWI3基因的表达趋势存在明显差异.
关键词:葡萄SWI3生物信息学表达分析胁迫响应
分类号:S663.1(果树园艺)
资助基金:河南省农业科学院自主创新项目(2025ZC35)河南省博士后科研项目(HN2024186)河南省农业科学院博士科研启动费项目(2026BX30)
论文发表日期:2026-04-15
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:11( 110-120 )
英文信息
