牡丹R2R3-MYB基因家族鉴定及花色形成相关基因筛选
闫庚洋
高文
李航
尚烨
张菊平
河南科技大学 园艺与植物保护学院,河南 洛阳 471000
摘要:基于牡丹全基因组数据对R2R3-MYB基因家族进行鉴定,研究其在牡丹花色形成中的作用,确定关键调控基因.利用生物信息学方法进行理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构、顺式作用元件、表达相关性及蛋白质互作分析,并通过qRT-PCR验证基因在牡丹样品中的表达模式.结果表明,共鉴定出78个牡丹R2R3-MYB转录因子,均位于细胞核,多为亲水性的不稳定蛋白,具有丰富的顺式作用元件以及N端高度保守的R2、R3结构域.系统进化将78个成员分为26个亚族(P1—P26),其中牡丹Ps2RMYB21、Ps2RMYB38和Ps2RMYB33分别与已知调控花色苷合成的拟南芥S4、S7同亚族,具有对应亚族特有的保守基序.Ps2RMYB33、Ps2RMYB38在正常萼片、彩色萼片、正常花瓣中的表达量依次升高,与结构基因PsCHS、PsCHI3、PsF3H1、PsDFR1、PsANS、PsUFGT4表达模式相同,表现为极显著的正相关性,与花色苷积累趋势一致.Ps2RMYB21与上述结构基因的表达模式相反,呈极显著负相关性,与花色苷积累趋势相反.qRT-PCR验证结果与转录组数据基本一致.综上,Ps2RMYB21、Ps2RMYB33、Ps2RMYB38是调控牡丹花色形成的3个关键基因.
关键词:牡丹花色R2R3-MYB基因家族生物信息学分析花色苷合成调控基因
分类号:S685.11(观赏园艺(花卉和观赏树林))
资助基金:河南省高等学校重点科研项目(17A210009)
论文发表日期:2025-12-15
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:17( 121-137 )
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