白芷种质遗传多样性与群体结构分析
许兰杰
安素妨
余永亮
董薇
梁慧珍
谭政委
杨青
杨红旗
吴晓慧
河南省农业科学院 中药材研究所,河南 郑州 450002;河南省中药材资源保护与利用重点实验室,河南 郑州 450002
摘要：为探明白芷亲本中材料的遗传多样性和群体结构特点,提高白芷种质的利用效率,选用28个目标起始密码子多态性(Start codon targeted polymorphism,SCoT)标记对来自5个白芷居群的78份种质进行PCR扩增,采用POPGENE 1.32、GenALEx6.502等软件研究其遗传多样性和群体结构.结果表明,28个SCoT标记共扩增出192个条带,其中多态性条带159个,平均每个标记的扩增条带数和多态性条带数分别是7、6个;SCoT标记的平均多态性信息含量值(PIC)、平均Shannon's多样性指数(I)和平均Nei's基因多样性指数(H)分别为0.800、0.350、0.240,表现出较高的遗传多样性.5个白芷居群每个位点平均等位基因数(Na)、平均有效等位基因数(Ne)、平均I和平均期望杂合度(He)分别为1.514、1.293、0.265、0.174,以禹白芷居群的Na、Ne、I、He最高.5个白芷居群遗传分化系数和基因流分别为0.135、3.195,94%遗传变异来自居群内,较大的基因流减少了居群间遗传差异.基于居群间的遗传相似系数(GS)在0.96处将5个白芷居群聚为三大类,其中禹白芷、杭白芷和川白芷居群被聚为一类;基于白芷种质的GS在0.765处将其聚为三大类,分别包含73、3、2份白芷种质.综上,5个白芷居群遗传多样性水平较低,种质间的亲缘关系较近,应加强白芷种质资源创制工作.
关键词：白芷种质SCoT标记遗传多样性群体结构聚类分析
分类号：S567.239(经济作物)R282.2(中药学)
资助基金：现代农业产业技术体系(CARS-21)河南省重点研发专项(241111310200)河南省重点研发专项(231111110800)河南省农科院基本科研业务费项目(2025ZC44)河南省农科院基本科研业务费项目(2025ZC45)中央本级重大增减支项目(2060302)河南省外籍科学家工作室项目(GZS2024025)河南省自主创新项目(2025ZC44)
论文发表日期：2025-07-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 64-71 )
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