水稻苗期耐旱性全基因组关联分析及候选基因预测
黄世鹏1
何虎强1
李光照1
陈传鑫1
钟拓1
谢剑波2
周湘晚2
王丹1
肖应辉1
1.湖南农业大学 农学院,湖南 长沙 4100002.新邵县农业农村局,湖南 新邵 422900
摘要：以水稻多样性群体RDP-Ⅱ中的355份种质为材料,以干旱复水后的黄叶率为耐旱评价指标,结合群体基因型数据进行全基因组关联分析(GWAS),并对耐旱相关候选基因进行分析,旨在为耐旱水稻培育提供优异种质资源及基因资源.结果表明,在RDP-Ⅱ群体中热带粳稻黄叶率最低,奥斯稻黄叶率最高.通过GWAS鉴定到17个耐旱相关SNP(单核苷酸多态性)位点,分布在水稻第1、2、3、6、7、8、11、12号染色体上,对峰值SNP附近10 kb区段进行候选基因预测,筛选出33个耐旱相关候选基因,主要包括蛋白激酶、转座子蛋白基因等.基于基因功能注释,挑选其中8个候选基因分别在耐旱种质和不耐旱种质中进行表达量分析,鉴定到表达差异显著的基因OsCTFdt、OsPEX1,分别正调控和负调控水稻苗期耐旱性.OsCTFdt、OsPEX1基因分别有4种单倍型,且优势单倍型的黄叶率均显著低于其他单倍型.
关键词：水稻苗期耐旱性全基因组关联分析候选基因预测单倍型
分类号：S511(禾谷类作物)
资助基金：湖南省自然科学基金项目(2022JJ30296)
论文发表日期：2025-07-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 12-20 )
英文信息