三穗鸭体尺与屠宰性状的全基因组关联分析

伍革民; 韩雪; 吴松成; 冯宇隆

doi:10.15933/j.cnki.1004-3268.2025.06.015

摘要：为了筛选出影响三穗鸭体尺和屠宰性状的遗传位点和功能基因,以655只160日龄三穗鸭为研究对象,测定体尺(体斜长、颈长)和屠宰性状(宰前活质量、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率)等表型数据,通过全基因组关联分析(10×深度)获取个体单核苷酸多态性(SNP)基因型,基于PLINK 1.9进行质控分析,利用GEMMA执行混合线性模型关联分析,并通过clusterProfiler对显著关联位点进行KEGG候选基因功能富集分析.结果表明,分别筛选到与体斜长、颈长、宰前活质量、屠体质量、全净膛质量、胸腿肌率显著关联的SNP位点207、78、64、66、68、96个,分别注释到50、31、32、40、27、37个候选基因.KEGG富集分析结果表明,与体斜长、颈长、宰前活质量、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率关联的候选基因分别富集到16、10、12、11、13、22条KEGG通路.其中,神经活性配体-受体相互作用与6个性状均有关,钙信号通路与体斜长、屠体质量、全净膛质量和胸腿肌率有关,MAPK信号通路与宰前活质量、屠体质量和全净膛质量有关.LOC119717855、GPR50、GRM7、GABRB2、GABRG2、LOC101800857等基因是体斜长的关键候选基因,GRIK2、BNIP1等基因是颈长的关键候选基因,TAF2和NRK基因是宰前活质量、屠体质量和全净膛质量的关键候选基因,SLC8A1基因是屠体质量和全净膛质量的关键候选基因,HTR2A、QRFPR、NPVF和UTS2R等基因是胸腿肌率的关键候选基因.综上,影响三穗鸭体尺与屠宰性状的主要KEGG通路为神经活性配体-受体相互作用、钙信号等信号通路,关键候选基因为LOC119717855、GPR50、GRIK2、TAF2等.