5个猪种DKK2基因结构变异DKK2-I1-sv89的多态性研究
龙菊烟1
卢圣菲2
田姣1
牛熙3
陈霞1
黄世会4
冉雪琴4
王嘉福3
1.贵州大学 生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室,贵州 贵阳 5500252.贵州大学 生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室,贵州 贵阳 550025;贵州电子科技职业学院,贵州 贵阳 5500253.贵州大学 生命科学学院/农业生物工程研究院/山地植物资源保护与保护种质创新教育部重点实验室,贵州 贵阳 550025;贵州省农业生物工程重点实验室,贵州 贵阳 550025;喀斯特山区植物资源利用与育种国家地方联合工程研究中心(贵州),贵州 贵阳 5500254.贵州大学 动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室,贵州 贵阳 550025
摘要：前期基因组学分析结果表明,猪Dickkopf-2(DKK2)基因内含子1中存在一个结构变异(89 bp,DKK2-I1-sv89),为探究该结构变异(SV)在不同猪品种中多态性分布以及对基因表达的影响,针对该SV序列设计特异性引物,通过PCR验证DKK2-I1-sv89在贵州地方猪种(香猪、黔北黑猪、柯乐猪、江口萝卜猪)和欧洲猪种(大白猪)共5个猪品种中的群体分布;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)检测不同基因型之间香猪卵巢组织中DKK2基因的表达差异;采用生物信息学分析DKK2-I1-sv89结构变异区存在的功能元件.结果表明,香猪和黔北黑猪检测到3种基因型(插入型Ⅱ、杂合型DI与野生型DD),大白猪仅检测到1种基因型(DD),柯乐猪、黔北黑猪检测到2种基因型(DI和DD).5个猪种比较,4个贵州地方猪种的插入型等位基因(I等位基因)频率均高于大白猪.生物信息学分析结果显示,DKK2-I1-sv89结构变异区含有1个内含子剪接增强子(ISE)和13个RNA结合蛋白(RBP)结合位点,定量性状位点(QTL)分析显示,该SV位点的QTL与繁殖、肉质和健康性状相关.进一步检测了Ⅱ型、DI型和DD型香猪卵巢组织中DKK2基因表达量,结果显示,Ⅱ型基因型极显著高于DI型和DD型,DI型和DD型无统计学差异.综上,DKK2-I1-sv89的多态性分布频率在贵州地方猪品种和欧洲猪种中有差异,且该SV的插入有利于DKK2基因在卵巢中的表达,可作为区分欧洲猪种和贵州地方猪种的分子标记.
关键词：猪DKK2基因结构变异多态性基因表达
分类号：S828(家畜)
资助基金：国家自然科学基金(32360810)国家自然科学基金(31960641)
论文发表日期：2025-04-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：7( 129-135 )
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