牡丹PomiR2592bj及其靶基因PoSDR1的克隆与生物信息学分析
雷炀1
高靖姗1
南琼琼2
郭丽丽1
侯小改1
1.河南科技大学农学院,河南洛阳 4710232.洛阳农发投资集团有限公司,河南洛阳 471023
摘要：基于前期对牡丹早花品种凤丹、凤丹早花突变植株和晚花品种连鹤转录组、miRNA和降解组联合分析,挖掘到调控牡丹花期的PomiR2592bj及其靶基因PoSDR1.为探究牡丹PomiR2592bj和PoSDR1的生物学特性及功能,克隆得到了113 bp的PomiR2592bj和1 380 bp的PoSDR1序列,二级结构分析表明,PomiR2592bj的前体序列可形成稳定的茎环结构,成熟序列分布在其3'臂端;多序列比对表明,PomiR2592bj成熟序列具有保守性;系统进化树分析显示,miR2592家族分为了10个分支,且具有同源性.PoSDR1基因编码的蛋白质含296个氨基酸,具有亲水性,不存在跨膜结构域,不存在信号肽,Ser位点有19个被磷酸化,Thr位点有11个被磷酸化,Tyr位点有2个被磷酸化,具有NADB_Rossmann超家族保守域.PomiR2592bj经预测与PoSDR1具有靶向关系.
关键词：牡丹PomiR2592bjPoSDR1克隆生物信息学
分类号：S682.1+9(观赏园艺（花卉和观赏树林）)
资助基金：国家自然科学基金(U1804233)河南省高校科技创新人才项目(22HASTIT036)
论文发表日期：2025-03-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 120-128 )
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