锦鲤let-7家族系统进化、靶基因预测及表达分析
李泓1
田月瑶2
崔开明2
秦楠2
范道省2
田雪2
朱文锦1
1.河南省水产科学研究院,河南郑州 4500442.河南师范大学水产学院,河南新乡 453007
摘要：对锦鲤let-7家族成员的前体序列进行比对和系统进化分析,检测锦鲤let-7家族成员表达量在体色形成过程中的变化,通过TargetScan和miRWalk对let-7j的靶基因进行预测,并对靶基因的本体特征和代谢通路进行富集分析,为了解let-7家族的进化历史及其在锦鲤及硬骨鱼类体色形成中的作用提供参考.结果表明,锦鲤let-7家族成员在鱼类中高度保守,且其前体序列的5'端保守性高于3'.锦鲤let-7家族成员表达量在体色形成的4个阶段均表现为逐步升高的趋势,在体色完全形成的孵化后47 d达到最高.利用TargetScan和miRWalk对let-7j的靶基因进行预测,其中571个靶基因在2个软件中均被预测到,这571个候选靶基因富集到了 10个与体色形成相关的GO条目,包括色素沉积、发育过程的色素沉积、色素细胞分化、黑色素细胞分化、细胞色素沉积、黑色素小体转运、色素颗粒转运、色素代谢过程、黑色素小体定位的建立和黑色素小体定位;富集到与体色相关的KEGG调控通路主要有Wnt信号通路、ErbB信号通路和黑色素沉积通路.以上GO和KEGG通路中存在ltk、pmel、plin6、kitlga和pax7a等多个与色素细胞分化和迁移相关的基因.综上,let-7家族成员在鱼类进化过程中高度保守,可能靶向色素细胞分化相关的基因参与锦鲤红色体色的形成.
关键词：锦鲤let-7家族系统进化let-7j靶基因体色
分类号：S965(水产养殖技术)
资助基金：河南省教育厅重点科研项目(22A240001)河南省农业科学院自主创新项目(2023ZC110)河南师范大学大学生创新创业项目(2023199)河南优势特色农业产业科技支撑行动计划项目(202310010040)
论文发表日期：2025-01-14
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：9( 144-152 )
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