地黄枯草芽孢杆菌全基因组测序及其促生作用相关基因研究
腊贵晓1
王林林2
郭军旗3
赵玉龙1
郭红霞1
贾慧2
杨铁钢1
1.河南省农业科学院 中药材研究所,河南 郑州 4500022.河南中医药大学 药学院,河南 郑州 4500463.沁阳市农业技术推广中心,河南 沁阳 454550
摘要：为了探究地黄枯草芽孢杆菌(Bacilus subtilis)对地黄促生作用的相关基因,对其进行全基因组测序,并通过功能注释挖掘促生作用相关基因.结果表明,地黄内生促生菌枯草芽孢杆菌基因组大小为4 310 699 bp,GC含量为43.44%,共预测编码基因4 521个.GO、COG、KEGG、CAZy、CARD和VFDB数据库注释的基因数分别为3 013、3 354、4 395、206、52、212.与促生作用有关基因有46个,这些基因主要集中在溶磷、固氮、铁载体等方面.同时,antiSMASH预测到共409个基因富集到12个次级代谢产物合成基因簇,主要编码合成丰原素、3-羧酸碳青霉烯、类双硫醇、杆菌溶素、羊毛硫类细菌素、表面活性肽、美好菌素酸和儿茶酚型嗜铁素等8种抑菌物质,其中美好菌素酸和儿茶酚型嗜铁素还具有螯合周围环境铁离子的作用.
关键词：枯草芽孢杆菌地黄全基因组测序功能注释内生菌促生基因
分类号：S567(经济作物)
资助基金：河南省现代农业产业技术体系项目(HARS-22-11-G2)现代农业产业技术体系(CARS-21)河南省重点研发专项(231111110800)
论文发表日期：2024-12-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 75-85 )
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