黄花蒿TCP转录因子鉴定及其在MeJA处理下的表达模式分析
马琦洋1
宋歌2
1.浙江中医药大学 滨江学院,浙江 杭州 310053;浙江中医药大学 第一临床医学院,浙江 杭州 3100532.浙江中医药大学 基础医学院,浙江 杭州 310053
摘要：基于黄花蒿基因组数据对TCP基因家族成员进行鉴定,并对其蛋白质理化性质、进化关系、顺式作用元件等进行分析.利用转录组数据分析黄花蒿TCP(AaTCP)转录因子在不同光处理下的表达模式,并利用qRT-PCR检测其在茉莉酸甲酯(MeJA)处理下的表达情况.结果表明,共鉴定出29个黄花蒿TCP基因(AaTCP).AaTCP在蛋白质理化性质上存在巨大差异,其中氨基酸数量和分子质量分别介于132～443个、14.60～47.86 ku,等电点、不稳定指数、脂肪系数分别介于5.67～9.99、33.28～69.77、51.70～77.40,且均为核蛋白.系统进化关系显示,AaTCP可被划分成Ⅰ类(11个)和Ⅱ类(18个),不均匀地分布在8条染色体上.AaTCP的Motif数量介于1～7,都含有1个保守的TCP2结构域,并且其启动子上存在大量的光、激素和胁迫响应元件.蛋白质互作预测结果显示,除AaTCP12和AaTCP8外,其余AaTCP蛋白成员之间存在紧密的互作关系.转录组数据表明,不同光处理下AaTCP的表达水平存在差异,大部分基因的表达均受光的诱导.qRT-PCR结果表明,不同AaTCP的表达量在MeJA处理下均有不同程度上升,随着处理时间的延长呈现出动态变化.综上,AaTCP基因家族在光调控及激素响应过程中发挥着重要作用.
关键词：黄花蒿TCP转录因子蛋白质互作茉莉酸甲酯
分类号：S567.219(经济作物)
资助基金：浙江省省级创业训练计划项目(S202310344003X)浙江省新苗人才计划项目(2023R410004)
论文发表日期：2024-12-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：13( 62-74 )
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