牡丹ARF基因家族鉴定及表达分析
赵银鸽1
袁欣2
高杰2
王慧娟2
李艳敏2
王晓晖3
师曼2
冯乃曦2
符真珠2
贾文庆4
1.河南省农业科学院园艺研究所,河南郑州 450002;河南科技学院园艺园林学院,河南新乡 4530032.河南省农业科学院园艺研究所,河南郑州 4500023.洛阳农林科学院,河南洛阳 4710234.河南科技学院园艺园林学院,河南新乡 453003
摘要：为研究牡丹生长素响应因子(Auxin response factor,ARF)家族基因,对其基因家族进行鉴定,并对其进行生物信息学分析.结果表明,在牡丹岛锦、凤丹、洛神晓春中共鉴定出19个ARF基因,以拟南芥ARF基因家族进化分类为依据,将牡丹ARF基因家族成员分为4个亚族,根据系统发育树发现,牡丹与拟南芥的ARF同源基因存在密切的进化关系.不同牡丹ARF蛋白长度、等电点存在差异.所有PsARF均含有保守的B3和Auxin_resp结构域,大部分PsARF还含有Aux/IAA结构域.保守基序分析表明,Motif数目为4～12个;基因结构分析显示,牡丹ARF基因内含子数量为1～19个;不同亚族间的Motif和内含子数目有一定的差异.组织表达特性分析显示,除PsARF2b在各个组织中不表达外,所有PsARF基因在牡丹组培苗根、茎、叶中均有表达,但在不同组织中的表达量存在很大差异,如PsARF7、PsARFJ9、PsARF8a、PsARF8b、PsARF6、PsARF11a、PsARF11b、PsARF9、PsARF16b、PsARF17、PsARFx 在根中的表达量最高,PsARF5、PsARF3、PsARF4 在茎中的表达量最高,而 PsARF2a、PsARF1、PsARF16a、PsARF10 在叶中的表达量最高.
关键词：牡丹ARF基因家族生物信息学基因表达
分类号：S685.11(观赏园艺（花卉和观赏树林）)
资助基金：河南省农业科学院杰出青年基金项目(2022JQ03)河南省农科院创新团队项目(2024TD36)
论文发表日期：2024-11-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 117-126 )
英文信息