苦荞PAL基因家族鉴定及表达分析
王清海1
贾燕华2
罗嫣然3
王安虎1
1.西昌学院厅州共建攀西特色作物研究与利用四川省重点实验室,四川西昌 6150132.西昌学院资源与环境学院,四川西昌 6150133.西昌学院农业科学学院,四川西昌 615013
摘要：利用生物信息学手段对苦荞PAL基因家族进行全基因组鉴定和分析,并利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测该基因家族在不同组织中的表达水平,为深入研究该基因家族的基本特征和基因功能提供一定的参考.结果表明,苦荞PAL基因家族共包含5个成员,分布于4条染色体上,其编码蛋白质的氨基酸数目介于688～722 aa;所有蛋白质理化性质相似,分子质量介于74 453.74～78 377.58 u,等电点介于5.64～6.28,均为稳定性蛋白和亲水性蛋白;亚细胞定位预测结果显示,所有蛋白质均定位于细胞质中;苦荞PAL基因家族与大豆有6对共线性基因,与紫花苜蓿有3对共线性基因;苦荞PAL家族蛋白质序列同源性较高,二级结构及保守基序的保守性较强,所有蛋白质均含有一个由Ala-Ser-Gly构成的MIO(亚甲基咪唑酮)活性基团;不同物种类群的PAL蛋白在进化上相对独立且保守;苦荞PAL基因家族成员启动子含有大量光响应、激素响应、胁迫响应和发育相关顺式作用元件.表达模式分析结果表明,5个PAL基因在苦荞各组织中均有不同程度的表达,其中FtPAL2基因在苦荞花器官中特异性高表达.
关键词：苦荞PAL基因家族鉴定生物信息学表达分析
分类号：S517(禾谷类作物)
资助基金：攀西特色作物研究与利用四川省重点实验室项目(XNFZ2201)攀西特色作物研究与利用四川省重点实验室项目(SZ21ZZ06)西昌学院博士科研启动基金(YBZ202311)西昌学院D类人才科研项目(D202409)
论文发表日期：2024-11-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：11( 63-73 )
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