基于转录组测序的蝴蝶兰低温胁迫响应MYB转录因子挖掘
梁芳1
张燕1
袁秀云1
康莹莹2
吴征3
许申平1
1.郑州师范学院 生物工程研究中心,河南 郑州 4500442.洛阳市孟津区公园管理和园林绿化中心,河南 洛阳 4711003.郑州师范学院 生命科学学院,河南 郑州 450044
摘要：为了探究MYB转录因子在抗冷型蝴蝶兰低温胁迫响应中的功能,从蝴蝶兰低温胁迫转录组文库中筛选出31条具有完整开放阅读框的MYB转录因子基因序列,对其蛋白质结构域、理化性质、系统进化、表达特性等进行分析.结果表明,有19条序列属于R2R3-MYB,其中所含R2氨基酸排列模式为W(T/S/I)X2EDX2LX7GX3WX2(L/V/I)X3(A/T/S)(G/S)LXR(C/T/S)GKSCRLRWXNY,R3氨基酸排列模式为(F/I/M/L)(S/T)X2EX3(I/V)(I/L/V)X(L/V)HX2(L/W)G(N/T)(R/K)W(S/A)XIAX2LPGRTDNE(I/V)KNXW-(N/R/H)(T/S/G);其余12条序列属于1R-MYB,R氨基酸排列模式为W(S/T)X(E/D)EHX2FLX(A/G)X4-(G/D)(R/K)G0～1(A/D)W或W(S/T)X(E/K)(Q/E)(N/D)KXFE(R/K)AL(A/V)X3(E/D)X(T/A)PXRW.这31条序列均具有Myb-DNA-binding结构域,平均相对分子质量为30 288.28,平均理论等电点为7.55,且都为疏水蛋白.蝴蝶兰MYB转录因子TRINITY_DN61754_c4_g1在抗冷品种大辣椒中的表达量于低温处理前后基本不变,但在不抗冷品种富乐夕阳中低温处理早期表达量就开始下降;TRINITY_DN74288_c0_g1在大辣椒中低温处理后48h表达量显著增加,而在富乐夕阳中低温处理24h后的表达量显著降低.结合其与小兰屿蝴蝶兰MYB转录因子的同源性分析及功能预测,推测这2个基因可能在蝴蝶兰低温胁迫响应过程发挥重要的作用.
关键词：蝴蝶兰MYB转录因子低温胁迫基因表达基因挖掘
分类号：S682.31(观赏园艺（花卉和观赏树林）)
资助基金：河南省科技攻关计划项目(222102110470)河南省高校重点科研项目(22A210025)河南省高校重点科研项目(24A220007)郑州地方高校大学生创新创业训练计划项目(DCY2022014)
论文发表日期：2024-08-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：10( 108-117 )
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