黄色小长蝽的线粒体基因组测序和分析
林兴雨
席玉强
宋南
尹新明
河南绿色害虫防治国际实验室/河南害虫生物防治工程实验室/河南农业大学 植物保护学院,河南 郑州 450046
摘要:为探究黄色小长蝽(Nysius inconspicuus)的线粒体基因组结构及长蝽科(Lygaeidae)昆虫的系统发育关系,利用二代测序方法获得黄色小长蝽线粒体全基因组序列,在系统发育分析中使用长蝽科14个物种作为内群,并选择大眼长蝽科(Geocoridae)的1个物种作为外群,利用最大似然法和贝叶斯法重建长蝽科的系统发育关系.结果表明,黄色小长蝽的线粒体基因组包含37个基因(13个蛋白质编码基因、22个转运RNA基因和2个核糖体RNA基因)和1个非编码控制区,全长为14 893 bp(GenBank登录号:OR099699).黄色小长蝽线粒体基因组的13个蛋白质编码基因除cox1和nad6利用TTG、nad4l利用AAC作为起始密码子,其余蛋白质编码基因都是以ATN开头,终止密码子除cox1、cox2、nad3和nad1以不完整的T作为结尾,其余蛋白质编码基因都是以TAA结尾.此外,基于3种不同的数据矩阵,分别采用2种系统发育分析方法得到的系统发育树结果基本一致.
关键词:黄色小长蝽半翅目长蝽科线粒体基因组系统发育
分类号:S433(病虫害及其防治)Q969(昆虫分类学)
资助基金:国家自然科学基金(U1904104)现代农业产业技术体系(CARS-27)
论文发表日期:2024-06-15
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:9( 91-99 )
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