欧洲葡萄NF-YB3基因克隆与表达分析
崔小月
尚泓泉
吕中伟
娄玉穗
张柯
樊红杰
吴文莹
张晓锋
河南省农业科学院 园艺研究所,河南 郑州 450002
摘要：为探究VvNF-YB3基因在葡萄生长发育和响应非生物胁迫过程中的功能,以无核白为试材,克隆得到了VvNF-YB3基因编码区序列,全长为624 bp,编码207个氨基酸,蛋白质等电点6.31,不稳定指数27.66,总平均疏水指数-0.738,为一酸性、稳定的亲水蛋白.通过生物信息学分析发现,VvNF-YB3基因位于10号染色体,含有1个内含子,编码蛋白质存在1个CBFD_NFYB_HMF结构域,与河岸葡萄NF-YB3相似性最高.VvNF-YB3的二级结构中α-螺旋和无规则卷曲占比较高,三级结构为单体的螺旋-卷曲-螺旋,启动子中包含响应激素和胁迫的多个顺式作用元件.VvNF-YB3基因在葡萄的叶片、卷须、花、幼果和茎中均表达,且在成熟的叶片中表达量最高.PEG模拟的干旱、低温和高温胁迫均可影响VvNF-YB3基因的表达,VvNF-YB3为一胁迫响应基因.VvNF-YB3的互作蛋白大多是核因子Y家族的亚基,ERF、bHLH、ARF等27个转录因子可能调控VvNF-YB3基因的表达.由此推测,VvNF-YB3基因可能通过受到上游转录因子的调控并与其他NF-Y蛋白互作响应各种环境胁迫.
关键词：葡萄NF-YB3基因克隆生物信息学分析表达分析
分类号：S663.1(果树园艺)
资助基金：国家葡萄产业技术体系项目(CARS-29-19)河南省科技攻关项目(222102110472)河南省农业科学院优秀青年科技基金项目(2022YQ08)河南省中央引导地方科技发展资金项目(Z20231811173)
论文发表日期：2024-04-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 111-118 )
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