鸡矢藤叶绿体基因组分析
吴民华1
吴子健2
叶晓霞1
谭靖怡3
王燊3
黄琼林1
1.广东医科大学 基础医学院,广东 湛江 5240232.广东医科大学 第一临床医学院,广东 湛江 5240233.广东医科大学 药学院,广东 湛江 524023
摘要：为了阐明岭南特色药用植物鸡矢藤的叶绿体基因组序列特征,采用高通量测序技术开展鸡血藤叶绿体基因组测序,再借助生物信息学方法对测得序列进行拼接、注释和比对分析.结果表明,鸡矢藤叶绿体基因组为153456 bp的环状双链四分体结构,共编码133个基因.在鸡矢藤叶绿体基因组中发现54个简单重复序列,其中A/T单核苷酸重复最多,占比61.1%;共找到26983个密码子,第3位碱基是A/T的密码子具有更高的使用频次.序列比对分析显示,鸡矢藤等5种茜草科植物在基因间隔区和内含子等非编码区域存在显著的碱基突变.系统进化树清晰地展现了鸡矢藤在茜草科内的进化位置,且不同来源的鸡矢藤序列同源性高.
关键词：鸡矢藤叶绿体基因组序列特点序列比对系统进化分析
分类号：S567.239(经济作物)
资助基金：广东省基础与应用基础研究基金项目(2018A030310116)广东省大学生创新创业训练计划项目(S202310571113)广东医科大学大学生创新创业训练计划项目(GDMU2022113)广东医科大学大学生创新创业训练计划项目(GDMU2023224)
论文发表日期：2024-01-15
在线出版日期：2026-09-12（本平台首次上网日期，不代表文献的发表时间）
页数：8( 70-77 )
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