基于SNP标记的4个品种复烤烟叶鉴别研究
杨金初1
童治军2
李萌3
赵旭1
徐永明1
冯颖杰1
杨宗灿1
曲鹏3
李悦1
孙九喆1
张轲4
1.河南中烟工业有限责任公司技术中心,河南 郑州 4500002.云南省烟草农业科学研究院/烟草行业烟草生物技术育种重点实验室/国家烟草基因工程研究中心,云南 昆明 6500213.郑州轻工业大学 食品与生物工程学院,河南 郑州 4500014.云南省烟草质量监督检测站,云南 昆明 650106
摘要:为探究单核苷酸多态性(SNP)标记在复烤烟叶品种鉴别上的可行性,开发基于SNP标记的复烤烟叶高效鉴别技术,对4个主栽烟草品种云烟87、红花大金元、K326及NC102的复烤烟叶进行了全基因组测序,应用全基因组数据发掘SNP位点,依据SNP位点设计了PCR引物,并对不同烟草品种进行了基因分型和区分.结果显示,4个品种复烤烟叶全基因组测序共获得21.5 Gb数据,共检测出27 137个SNP位点.挑选其中53个SNP位点设计不同错配类型等位基因引物570条,扩增结果均与预期一致.SNP位点35、45和51在品种间具有多态性,红花大金元在35、45、51位点基因型为T/T、C/C、T/T;K326为C/T、C/T、C/C;NC102为C/T、C/T、C/T;云烟87烟叶在35位点无扩增,在45、51位点的基因型为C/T、C/T.依据3个SNP位点的基因型构建不同品种的分子ID,可准确区分4个品种的复烤烟叶.
关键词:复烤烟叶品种鉴别全基因组测序SNP位点等位基因多态性
分类号:S57(农作物)TS45(烟草工业)
资助基金:中国烟草总公司重点研发计划项目(110202202038)中国烟草总公司云南省公司科技项目(2020530000241034)中国烟草总公司云南省公司科技项目(2023530000241027)
论文发表日期:2023-11-15
在线出版日期:2026-09-12(本平台首次上网日期,不代表文献的发表时间)
页数:7( 174-180 )
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河南农业科学

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CSTPCD北大核心
ISSN:1004-3268
年,卷(期):2023,52(11)
所属栏目:农业信息与工程·农产品加工